Комитет против пыток решил ликвидироваться после его внесения в реестр некоммерческих организацией, выполняющих функции иностранного агента. Это было сделано на основании представления прокурора Нижегородской области Олега Понасенко. Организации не удалось отменить этот статус в суде, после чего было принято решение о ликвидации.
С августа 2014 года КПП продолжила свою деятельность как МРОО «Комитет по предотвращению пыток». Между тем, Минюст внес в реестр НКО-иноагентов и эту организацию.
